生物论文参考文献引用:基因序列/物种分类的标注

生物论文中，参考文献引用时基因序列与物种分类标注至关重要，基因序列标注需准确呈现序列来源、登录号等信息，确保可追溯性与科学性；物种分类标注则要依据权威分类系统，明确物种学名及分类地位，避免混淆，正确标注不仅体现研究的严谨性，也为后续研究者提供清晰指引，促进学术交流与知识传承，是生物论文不可或缺的关键环节 。

在生物论文中，基因序列和物种分类的标注需严格遵循国际生物命名法规及目标期刊的具体要求,以下是具体标注规范及示例：

基因序列的标注规范

1. 基因名称与符号

   • 通用规则：首次出现基因时，需标注官方名称及符号，旧名称需括号备注。
     示例：我们使用抗POU5F1蛋白的抗体（以前称为OCT-4）。
   • 物种差异：
     • 小鼠/大鼠/鸡：基因符号斜体，首字母大写，其余小写（如Igf1）；蛋白质名称全大写且不斜体（如IGF1）。
     • 人类/非人类灵长类/家畜：基因符号斜体且全大写（如IGF1）；蛋白质名称同基因符号但正体（如IGF1）。
     • 鱼类：基因名称斜体且全小写（如cyclops）；基因符号斜体全小写（如cyc）；蛋白质首字母大写且不斜体（如Cyc）。

2. mRNA与cDNA标注

   • 基因符号需斜体，并明确描述对象。
     示例：...levels of Igf1 mRNA increased when...

3. 突变等位基因标注

   • 首次出现时需详细列出，符号用上标，字母数字斜体。
     示例：Igf1^tm1Arge is one of several knockout alleles of Igf1.
   • 纯合子/杂合子表示：纯合子为Igf1，杂合子为Igf1。

4. 数据库ID标注

   • 引用基因序列时，需标注数据库来源及ID（如NCBI Entrez Gene、Ensembl）。
     示例：TP53基因的Entrez ID为7157，Ensembl ID为ENSG00000141510。

物种分类的标注规范

1. 分类等级标注

   • 使用国际通用的分类等级（界、门、纲、目、科、属、种），拉丁学名斜体，首字母大写。
     示例：人类属于动物界（Animalia）、脊索动物门（Chordata）、哺乳纲（Mammalia）、灵长目（Primates）、人科（Hominidae）。

2. 分类索引工具

   • 生物分类索引（Biosystematic Index）：按门、纲、目、科等大类群检索文献，需结合《主题指南》确定类目位置。
     示例：查“麦类形态解剖”文献，需定位至被子植物门（Angiospermae）、单子叶植物纲（Monocotyledones）、禾本科（Gramineae）。
   • 属类索引（Generic Index）：按属种双名法拉丁学名检索，说明语缩写，文摘号直接对应文献。

3. 物种名称变更

   • 旧名称需括号备注，优先使用最新分类名称。
     示例：Brassica rapa（曾用名Brassica campestris）。

参考文献标注示例

1. 基因序列引用

   • 格式：作者. 年份. 基因名称（符号）[数据库ID]. 数据库名称.
     示例：Smith J, et al. 2023. Insulin-like growth factor 1 (IGF1) [ENSG00000141510]. Ensembl.

2. 物种分类引用

   • 格式：作者. 年份. 物种拉丁学名（分类等级）. 文献类型.
     示例：Doe A, et al. 2022. Homo sapiens (Primates: Hominidae). J Mol Evol.

3. 突变体引用

   • 格式：作者. 年份. 基因符号^突变体（等位基因描述）. 文献类型.
     示例：Lee S, et al. 2021. Igf1^tm1Arge (knockout allele). Genetics.

注意事项

1. 期刊要求：不同期刊可能对斜体、大小写、缩写有特殊规定，投稿前需核对格式指南。
2. 一致性：全文基因符号、物种名称需统一，避免混用旧名或缩写。
3. 工具辅助：
   • 基因注释：使用NCBI Entrez Gene、Ensembl、biomaRt等工具查询基因ID及命名规则。
   • 分类检索：利用《主题指南》、生物分类索引、属类索引定位文献。